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如何寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA?

2017-04-15 医药加 免疫细胞研究bioworld

本次研讨班主题:


如何寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA


课程目标

  虽然近年来lncRNA的研究成为生物医学领域的大热门,陆续有新的lncRNA序列被报道,但是绝大多数lncRNA的功能和作用机制仍不清楚。本课程将结合CRISPR/Cas9基因编辑技术与lncRNA两大研究热点,分析如何使用已建立的CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA,以及如何进一步开展后续的lncRNA功能和作用机制研究。本次课程将从背景介绍、研究思路、案例分析三个方面,系统、全面并深入浅出地介绍和分析lncRNA的研究策略,内容涵盖实验方案设计、研究手段运用以及具体案例分析及有lncRNA研究必备实验方法的操作要点,授课对象面向生物、医学领域的科研工作人员。


课程概要

  

Functional analysis of lncRNAs through CRISPR/Cas9-based library screening

(Experimental approaches)


什么是lncRNA?

lncRNA的定义、特点、分类、功能

如何去寻找疾病或信号通路中关键的调控性lncRNA

library screen

lncRNA profiling

如何利用CRISPR/Cas9 lncRNA library筛选疾病或信号通路中关键的调控性lncRNA?

直接利用CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找关键性lncRNA

利用报告基因结合CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找关键性lncRNA

如何验证筛选出的lncRNA的可靠性?

lncRNA过表达

lncRNA knockout

实验方案和课题设计

辅导学员课题设计

解答具体实验操作问题

      





讲师简介

  


 莫寅元教授:1956年出生杭州,1982年毕业于浙江大学。1991年获美国华盛顿州立大学植物病理博士学位。1992-1994年在美国华盛顿州了大学微生物博士后研究。曾就职于孟菲斯St. Jude 儿童研究医院、芝加哥伊利诺州大学。参与美国CDMRP项目,NIH项目和我国国家自然项目评选。现为密西西比大学医学中心癌症研究院药理、毒理学教授,癌症项目主要负责人。主要研究mirRNA 和长非编码RNA在肿瘤发生、发展中的作用及药物的抵抗。



课程设置

第一天课程安排:

 

9:00-10:20 Introduction

Discovery of lncRNAs

Characteristics of lncRNAs

Significance of lncRNAs

Classification of lncRNAs

LncRNA-mediated gene regulation

How to select lncRNAs of your interest

Database search (lncRNA targets; TCGA; and Lncipedia etc)

 

10:00-10:40 Tea break

 

10:40-12:00 CRISPR/Cas9 basics

How CRISPR/Cas9 works

gRNA design (online programs)

sgRNA vs dual gRNAs

LncRNA KO, gene silencing and gene activation

Generation of KO or gene activation libraries

Rescue

Genome browser (https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQblat.html)

 

12:00-14:00 Lunch

 

14:00-15:20 Screening approaches

CRISPR/Cas9-based library screening

Direct screening

Reporter assisted screening

Types of reporters

Target validation

 

15:20-15:40 Tea break

 

15:40-15:10 Examples of screening

 

15:10-16:00 Q&A, consultation for project design


第二天没有具体课程,安排学员们与莫教授深入交流

莫教授会给有兴趣的学员做单独指导lncRNA文库筛选与实验设计



声明 illustration

本次培训班是非编码RNA学习的拓展提高班,凡是参加过4.15号北京非编码RNA学习班的学员,可以享受每位500元优惠! 


上海lncRNA研讨班培训时间2017年5月27日-5月28日培训地点上海中兴和泰酒店会议厅,上海市浦东张江高科科苑路866相关介绍

主办方:医药加平台,上海遐永医药科技有限公司


酒店推荐: 上海中兴和泰酒店


【收费标准】

 2200元每位,优惠措施:5月10号之前确认报名及转账的优惠200元,可以开正规会务发票,授课期间发放纸质邀请函(盖章)。 注册费包含电子版教材、午餐等费用,但不包括住宿费和晚餐。  



报名方式


长按识别下面二维码, 填写报名登记表 





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