如何寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA?
本次研讨班主题:
如何寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA
虽然近年来lncRNA的研究成为生物医学领域的大热门,陆续有新的lncRNA序列被报道,但是绝大多数lncRNA的功能和作用机制仍不清楚。本课程将结合CRISPR/Cas9基因编辑技术与lncRNA两大研究热点,分析如何使用已建立的CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA,以及如何进一步开展后续的lncRNA功能和作用机制研究。本次课程将从背景介绍、研究思路、案例分析三个方面,系统、全面并深入浅出地介绍和分析lncRNA的研究策略,内容涵盖实验方案设计、研究手段运用以及具体案例分析及有关lncRNA研究必备实验方法的操作要点,授课对象面向生物、医学领域的科研工作人员。
Functional analysis of lncRNAs through CRISPR/Cas9-based library screening
(Experimental approaches)
什么是lncRNA?
lncRNA的定义、特点、分类、功能
如何去寻找疾病或信号通路中关键的调控性lncRNA?
library screen
lncRNA profiling
如何利用CRISPR/Cas9 lncRNA library筛选疾病或信号通路中关键的调控性lncRNA?
直接利用CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找关键性lncRNA
利用报告基因结合CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找关键性lncRNA
如何验证筛选出的lncRNA的可靠性?
lncRNA过表达
lncRNA knockout.
实验方案和课题设计
辅导学员课题设计
解答具体实验操作问题
莫寅元教授:1956年出生杭州,1982年毕业于浙江大学。1991年获美国华盛顿州立大学植物病理博士学位。1992-1994年在美国华盛顿州了大学微生物博士后研究。曾就职于孟菲斯St. Jude 儿童研究医院、芝加哥伊利诺州大学。参与美国CDMRP项目,NIH项目和我国国家自然项目评选。现为密西西比大学医学中心癌症研究院药理、毒理学教授,癌症项目主要负责人。主要研究mirRNA 和长非编码RNA在肿瘤发生、发展中的作用及药物的抵抗。
第一天课程安排:
9:00-10:20 Introduction
Discovery of lncRNAs
Characteristics of lncRNAs
Significance of lncRNAs
Classification of lncRNAs
LncRNA-mediated gene regulation
How to select lncRNAs of your interest
Database search (lncRNA targets; TCGA; and Lncipedia etc)
10:00-10:40 Tea break
10:40-12:00 CRISPR/Cas9 basics
How CRISPR/Cas9 works
gRNA design (online programs)
sgRNA vs dual gRNAs
LncRNA KO, gene silencing and gene activation
Generation of KO or gene activation libraries
Rescue
Genome browser (https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQblat.html)
12:00-14:00 Lunch
14:00-15:20 Screening approaches
CRISPR/Cas9-based library screening
Direct screening
Reporter assisted screening
Types of reporters
Target validation
15:20-15:40 Tea break
15:40-15:10 Examples of screening
15:10-16:00 Q&A, consultation for project design
第二天没有具体课程,安排学员们与莫教授深入交流
莫教授会给有兴趣的学员做单独指导lncRNA文库筛选与实验设计
声明 illustration
本次培训班是非编码RNA学习的拓展提高班,凡是参加过4.15号北京非编码RNA学习班的学员,可以享受每位500元优惠!
主办方:医药加平台,上海遐永医药科技有限公司
酒店推荐: 上海中兴和泰酒店
【收费标准】
2200元每位,优惠措施:5月10号之前确认报名及转账的优惠200元,可以开正规会务发票,授课期间发放纸质邀请函(盖章)。 注册费包含电子版教材、午餐等费用,但不包括住宿费和晚餐。
报名方式:
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